DOCKING MOLEKULER SENYAWA HESPERIDIN DALAM TANAMAN KULIT JERUK NIPIS ( CITRUS AURANTIFOLIA SWINGLE ) SEBAGAI PENGHAMBAT ENZIM TIROSINASE DENGAN AUTODOCK-VINA

Ervina Novitasari

Abstract


Hidrokuinon telah digunakan dalam kosmetik karena memiliki aktivitas sebagai pemutih. Pada penelitian sebelumnya, Hesperidin dalam tanaman Jeruk Nipis juga diketahui memiliki aktivitas sebagai penghambat enzim tirosinase. Perlu diketahui bagaimana mekanisme interaksi senyawa Hesperidin terhadap tirosinase (5M8N) dan senyawa manakah antara hidrokuinon dan Hesperidin yang memberikan aktivitas sebagai pemutih yang lebih baik secara komputasi.Tirosinase dipreparasi menggunakan Discovery Studio Visualizer. Ligan dipreparasi dengan menggunakan Autodock 1.5.6, Biovia Discovery Studio Visualizer, Molegro, Marvin sketch chem axon, Notepad++ dan Command Window. Hasil molecular docking ligan senyawa hesperidin terhadap enzim tirosinase (5M8N) didapatkan nilai energi bebas ikatan yaitu -7,49 sedangkan untuk ligan senyawa hidrokuinon terhadap enzim tirosinase (5M8N) didapatkan . Dari hasil visualisasi struktur 2D dan 3D pada molecular docking reseptor dengan ligan hesperidin terdapat beberapa jenis interaksi ikatan diantaranya ikatan van der Waals, ikatan hidrogen konvensional, ikatan karbon hidrogen, Pi-Cation, dan alkil. Sedangkan pada hasil visualisasi struktur 2D dan 3D pada molecular docking reseptor dengan ligan hidrokuinon terdapat beberapa jenis interaksi ikatan yaitu ikatan van der Waals, ikatan hydrogen konvensional, ikatan karbon hidrogen, dan Pi-Pi Stacked.

Full Text:

PDF

Refbacks

  • There are currently no refbacks.


Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.