Universitas Bakti Tunas HusadaMOLECULAR DOCKING SENYAWA METHYL CAFFEATE DARI TAKOKAK (Solanum torvum) SEBAGAI ANTIDIABETES
Abstract
Methyl Caffeate merupakan ester asam caffeic senyawa fenolik alami yang di isolasi dari buah takokak (Solanum torvum) yang memiliki aktivitas penghambat glucosidase. methyl caffeate terbukti manjur dalam perlindungan yang telah dilaporkan dalam model seluler stress oksidatif (Gandhi et al., 2011). Reseptor Insulin di download dari Protein Data Bank (PDB) (Kode 2AUH). Docking dilakukan dengan menggunakan Autodock. Parameter yang digunakan yaitu parameter Root Mean Square Deviation (RMSD). hasil validasi docking dalam code PDB 2AUH (Reseptor Insulin) dengan ligan alami dan ligan uji. Parameter docking dipilih dari running terbaik yaitu untuk ligan alami pada running ke-7 dan ligan uji pada running ke-8 menunjukan binding energi untuk ligan alami adalah -9,88 kkal/mol dan untuk ligan uji -4,91 kkal/mol. dan RMSD dari ligan alami sebesar 2,33 dan ligan alami uji sebesar 104,25. hasil ligan uji menunjukan bahwa residu asam amino yang berinteraksi adalah LYS1165, VAL1185, PHE1186, VAL1129, ASP1161, ILE1157, ARG1155, ARG1164, ARG1131, GLY1166. hasil ini menunjukan bahwa senyawa uji dapat berikatan dengan reseptor, tetapi memiliki binding energi yang kurang baik karena nilai yang terbaik 2.
Full Text:
PDF (Indonesian)References
Gandhi, G. R., Ignacimuthu, S., Paulraj, M. G., & Sasikumar, P. (2011). Antihyperglycemic activity and antidiabetic effect of methyl caffeate isolated from Solanum torvum Swartz. fruit in streptozotocin induced diabetic rats. European Journal of Pharmacology, 670(2–3), 623–631. https://doi.org/10.1016/j.ejphar.2011.09.159
Perkeni. (2019). Pengelolaan Dan Pencegahan Diabetes Melitus Tipe 2 Dewasa di Indonesia. In Perkumpulan Endokrinologi Indonesia.
Prasetiyo, A., Mumpuni, E., & R. Tjandrawinata, R. (2019). Docking Molekular dari Trigonella foenum-graceum sebagai Antidiabetes menggunakan Molegro Virtual Docking. Jurnal Jamu Indonesia, 4(2), 74–80. https://doi.org/10.29244/jji.v4i2.132
Ruswanto, R. (2015). MOLECULAR DOCKING EMPAT TURUNAN ISONICOTINOHYDRAZIDE PADA MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS ENOYL-ACYL CARRIER PROTEIN REDUCTASE (InhA). Jurnal Kesehatan Bakti Tunas Husada: Jurnal Ilmu-Ilmu Keperawatan, Analis Kesehatan Dan Farmasi, 13(1), 135–141. https://doi.org/10.36465/jkbth.v13i1.25.
Ruswanto, R. (2015). Desain dan pemodelan molekul turunan 1, 3-dibenzoil tiourea sebagai inhibitor chk1 secara in silico. Jurnal Kesehatan Bakti Tunas Husada: Jurnal Ilmu-ilmu Keperawatan, Analis Kesehatan dan Farmasi, 9(1), 14.
Ruswanto, R., Nofianti, T., Mardianingrum, R., & Kesuma, D. (2022). Design, molecular docking, and molecular dynamics of thiourea-iron (III) metal complexes as NUDT5 inhibitors for breast cancer treatment. Heliyon, 8(9).
Ruswanto, R., Ratnasari, A., & Tuslinah, L. (2015). Sintesis Senyawa N’-(3, 5-Dinitrobenzoyl)-Isonicotinohydrazide Dan Studi Interaksinya Pada Mycobacterium Tuberculosis Enoyl Acyl Carrier Protein Reductase (INHA). Jurnal Kesehatan Bakti Tunas Husada: Jurnal Ilmu-ilmu Keperawatan, Analis Kesehatan dan Farmasi, 14(1), 63-73.
Ruswanto, R., Mardianingrum, R., & Yanuar, A. (2022). Computational studies of thiourea derivatives as anticancer candidates through inhibition of Sirtuin-1 (SIRT1). Jurnal Kimia Sains dan Aplikasi, 25(3), 87-96.
Wardani, F. (2012). Studi Derivat Ribavirin dan GTP sebagai Inhibitor untuk NS5 Metiltransferase virus Denger. Universitas Indonesia.
Refbacks
- There are currently no refbacks.
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.